Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AregP31955 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AregP31955 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AregP31955 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AregP31955 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AregP31955 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AregP31955 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AregP31955 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AregP31955 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms