Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd2P30280 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccnd2P30280 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd2P30280 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms