Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VtnP29788 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VtnP29788 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VtnP29788 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VtnP29788 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VtnP29788 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VtnP29788 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VtnP29788 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VtnP29788 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VtnP29788 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VtnP29788 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VtnP29788 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VtnP29788 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VtnP29788 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VtnP29788 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms