Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OatP29758 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OatP29758 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OatP29758 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OatP29758 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OatP29758 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OatP29758 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OatP29758 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OatP29758 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OatP29758 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OatP29758 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OatP29758 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OatP29758 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OatP29758 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OatP29758 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OatP29758 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OatP29758 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OatP29758 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OatP29758 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OatP29758 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OatP29758 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms