Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprmP28828 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprmP28828 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprmP28828 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprmP28828 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PtprmP28828 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprmP28828 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtprmP28828 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtprmP28828 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PtprmP28828 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms