Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RxraP28700 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RxraP28700 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RxraP28700 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RxraP28700 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RxraP28700 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RxraP28700 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RxraP28700 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RxraP28700 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RxraP28700 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RxraP28700 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RxraP28700 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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