Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BgnP28653 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BgnP28653 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BgnP28653 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BgnP28653 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BgnP28653 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BgnP28653 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BgnP28653 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BgnP28653 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BgnP28653 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BgnP28653 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BgnP28653 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BgnP28653 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BgnP28653 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BgnP28653 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BgnP28653 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BgnP28653 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BgnP28653 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BgnP28653 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BgnP28653 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BgnP28653 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BgnP28653 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BgnP28653 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BgnP28653 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BgnP28653 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BgnP28653 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BgnP28653 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BgnP28653 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms