Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col2a1P28481 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col2a1P28481 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col2a1P28481 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms