Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd9P28357 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd9P28357 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms