Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Etv4P28322 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Etv4P28322 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms