Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aco1P28271 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aco1P28271 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aco1P28271 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aco1P28271 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aco1P28271 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aco1P28271 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms