Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pde6aP27664 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde6aP27664 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde6aP27664 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms