Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CftrP26361 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CftrP26361 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CftrP26361 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CftrP26361 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CftrP26361 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CftrP26361 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CftrP26361 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CftrP26361 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CftrP26361 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CftrP26361 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CftrP26361 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CftrP26361 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CftrP26361 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CftrP26361 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CftrP26361 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
CftrP26361 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CftrP26361 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CftrP26361 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CftrP26361 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CftrP26361 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CftrP26361 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CftrP26361 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CftrP26361 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CftrP26361 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CftrP26361 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CftrP26361 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CftrP26361 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CftrP26361 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CftrP26361 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CftrP26361 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CftrP26361 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CftrP26361 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CftrP26361 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CftrP26361 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CftrP26361 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CftrP26361 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CftrP26361 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CftrP26361 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CftrP26361 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
CftrP26361 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CftrP26361 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CftrP26361 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CftrP26361 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CftrP26361 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CftrP26361 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CftrP26361 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CftrP26361 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CftrP26361 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CftrP26361 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CftrP26361 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CftrP26361 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CftrP26361 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CftrP26361 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CftrP26361 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CftrP26361 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CftrP26361 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CftrP26361 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CftrP26361 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CftrP26361 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CftrP26361 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CftrP26361 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CftrP26361 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CftrP26361 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CftrP26361 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CftrP26361 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CftrP26361 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CftrP26361 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CftrP26361 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CftrP26361 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CftrP26361 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CftrP26361 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CftrP26361 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CftrP26361 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms