Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf1bP25119 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms