Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gria1P23818 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms