Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk1P22518 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clk1P22518 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms