Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TP20293 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TP20293 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TP20293 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TP20293 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TP20293 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TP20293 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TP20293 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TP20293 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TP20293 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TP20293 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TP20293 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TP20293 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TP20293 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TP20293 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TP20293 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TP20293 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP20293 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TP20293 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TP20293 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms