Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pou5f1P20263 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pou5f1P20263 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms