Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a1P19437 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a1P19437 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a1P19437 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms