Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P18529 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18529 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18529 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18529 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18529 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18529 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18529 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18529 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P18529 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18529 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18529 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18529 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms