Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cxcl9P18340 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl9P18340 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms