Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sptan1P16546 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sptan1P16546 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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