Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme1P15532 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme1P15532 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms