Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Irf1P15314 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irf1P15314 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms