Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmnb1P14733 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmnb1P14733 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmnb1P14733 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms