Protein–RNA interactions for Protein: P14115

Rpl27a, 60S ribosomal protein L27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27aP14115 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27aP14115 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27aP14115 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27aP14115 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27aP14115 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27aP14115 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl27aP14115 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl27aP14115 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms