Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga5P11688 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga5P11688 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms