Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lire1P11260 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lire1P11260 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lire1P11260 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms