Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp1P11103 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp1P11103 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Parp1P11103 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Parp1P11103 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Parp1P11103 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Parp1P11103 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Parp1P11103 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Parp1P11103 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms