Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tnp1P10856 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms