Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl2P10148 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms