Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6c1P0CW02 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly6c1P0CW02 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms