Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb2P0C1T1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb2P0C1T1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxb2P0C1T1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb2P0C1T1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb2P0C1T1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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