Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa6P09092 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa6P09092 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa6P09092 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa6P09092 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa6P09092 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms