Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd3P09027 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms