Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr1P08046 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr1P08046 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Egr1P08046 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms