Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa4P06798 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa4P06798 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms