Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9P06683 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9P06683 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C9P06683 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C9P06683 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C9P06683 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P06683 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P06683 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P06683 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P06683 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P06683 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9P06683 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9P06683 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9P06683 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9P06683 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9P06683 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms