Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Saa2P05367 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa2P05367 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa2P05367 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms