Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Got1P05201 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Got1P05201 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Got1P05201 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Got1P05201 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Got1P05201 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Got1P05201 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Got1P05201 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Got1P05201 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Got1P05201 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Got1P05201 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Got1P05201 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Got1P05201 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Got1P05201 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Got1P05201 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Got1P05201 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Got1P05201 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Got1P05201 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Got1P05201 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Got1P05201 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Got1P05201 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Got1P05201 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Got1P05201 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms