Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P04212 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P04212 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04212 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04212 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04212 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04212 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04212 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P04212 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P04212 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04212 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04212 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04212 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04212 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P04212 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P04212 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04212 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04212 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04212 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04212 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04212 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04212 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P04212 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04212 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04212 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04212 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04212 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04212 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04212 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04212 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04212 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04212 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04212 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04212 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04212 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms