Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01820 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01820 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01820 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01820 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01820 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01820 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01820 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01820 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01820 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01820 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01820 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01820 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01820 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms