Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01796 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01796 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01796 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01796 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01796 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01796 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01796 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01796 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01796 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01796 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01796 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01796 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01796 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01796 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms