Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01789 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01789 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01789 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01789 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01789 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01789 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01789 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01789 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01789 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01789 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01789 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
P01789 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01789 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms