Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01735 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01735 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01735 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01735 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01735 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01735 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01735 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01735 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01735 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01735 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01735 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01735 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01735 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms