Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01734 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01734 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01734 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
P01734 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P01734 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01734 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01734 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01734 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01734 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P01734 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01734 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01734 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01734 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01734 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01734 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01734 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01734 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01734 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms