Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01667 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01667 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01667 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01667 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01667 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01667 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01667 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01667 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01667 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01667 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01667 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01667 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01667 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01667 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01667 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms