Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01649 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01649 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01649 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01649 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01649 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01649 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01649 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01649 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01649 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01649 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01649 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01649 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms