Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifnb1P01575 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifnb1P01575 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms