Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Robo1O89026 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Robo1O89026 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Robo1O89026 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Robo1O89026 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Robo1O89026 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms